KEGG pathway富集结果二级分类汇总图
简介
根据KEGG官网
通路分类页面,pathway可以分成3个级别,我们最常用的是第3级别,通过将第3级别汇总,在第2级别上进行查看,能够更容易地从整体上发现通路所属。
数据说明
数据为两列,第一列是KEGG pathway名字,第二列是pathway中富集的基因,以/分割。然后根据
KEGG Pathway分类页面中的前6种进行二级分类汇总!
注意:不同软件出来的名字不是很统一,这里未分类的需要自己手工改下,然后重新提交绘图。20260326更新
论文例子
CAV1 alleviated CaOx stones formation via suppressing autophagy-dependent ferroptosis Fig3e
如何引用?
建议直接写网址。助力10000+篇
(google学术),8500+篇
(知网)论文
正式引用:Tang D, Chen M, Huang X, Zhang G, Zeng L, Zhang G, Wu S, Wang Y.
SRplot: A free online platform for data visualization and graphing. PLoS One. 2023 Nov 9;18(11):e0294236. doi: 10.1371/journal.pone.0294236. PMID: 37943830.
方法章节:Heatmap was plotted by https://www.bioinformatics.com.cn (last accessed on May 4, 2026), an online platform for data analysis and visualization.
致谢章节:We thank Mingjie Chen (Shanghai NewCore Biotechnology Co., Ltd.) for providing data analysis and visualization support.