用前必读
1，使用excel存储并调整数据，数据不要有空的单元格
2，先用输入框下方的“输入检查”按钮检查输入，通过后再作图
3，表头请勿使用#，<，>，%，(，)等特殊符号。默认仅支持英文字符
4，出图后用inkscape或acrobat illustrator修改pdf文字、字体，图例，处理截断
5，生信项目合作，提交bug、发文引用换积分，请加管理员微信（右下）

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曼哈顿图

简介
曼哈顿图是一种散点图，通常用于显示具有大量数据点，许多非零振幅和更高振幅值分布的数据。该图通常用于全基因组关联研究（GWAS）以显示重要的SNP。图中每个点代表一个SNP，纵轴为每个SNP计算出来的Pvalue取-log10，横轴为SNP所在的染色体。基因位点的Pvalue越小即-log10(Pvalue)越大，其与表型性状或疾病等关联程度越强。而且通常来说受到连锁不平衡的影响，强关联位点周围的SNP也会显示出相对较高的信号强度，并依次向两边递减，所以会出现上图中红色部分的现象。一般，在GWAS的研究中，Pvalue的阈值在10^-6 或者10^-8以下。参考：https://www.jianshu.com/p/1edc44fe922f
数据说明
第一列是SNP名字，第二列是染色体（不带chr）；第三列是位置；第四列为p值。调用R包：CMplot
论文例子
Non-Heading Chinese Cabbage Database: An Open-Access Platform for the Genomics of Brassica campestris (syn. Brassica rapa) ssp. chinensis. Fig5f
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正式引用：Tang D, Chen M, Huang X, Zhang G, Zeng L, Zhang G, Wu S, Wang Y. SRplot: A free online platform for data visualization and graphing. PLoS One. 2023 Nov 9;18(11):e0294236. doi: 10.1371/journal.pone.0294236. PMID: 37943830.
方法章节：Heatmap was plotted by https://www.bioinformatics.com.cn (last accessed on May 4, 2026), an online platform for data analysis and visualization.
致谢章节：We thank Mingjie Chen (Shanghai NewCore Biotechnology Co., Ltd.) for providing data analysis and visualization support.